Le laboratoire de Biologie Moléculaire et de Microbiologie (LBMM) de l’Institut de Recherche en Ecologie Tropicale (IRET) est un laboratoire de type P2 qui a été aménagé en 2009 par le budget d’investissement propre de l’IRET.
Grace aux efforts conjugués de l’IRET et ses partenaires internationaux, principalement la coopération Japonaise à travers le projet « Conservation de la Biodiversité en forêt tropicale à travers la Coexistence Durable entre L’Homme et l’Animal » (PROCOBHA) financé par l’Agence Japonaise de
Coopération Internationale (JICA), ce laboratoire a été totalement équipé en avril 2014.

Le Laboratoire de Biologie Moléculaire et de Microbiologie est un laboratoire de type P2. Il comprend deux unités : l’unité de Biologie moléculaire et l’unité de Microbiologie.

L’unité de Biologie Moléculaire
Cette unité est dédiée aux différentes recherches sur le génome (ADN ou ARN) provenant des organismes vivants tels que les animaux (ADN), les plantes (ADN), les bactéries (ADN), les champignons (ADN), les parasites (ADN) et les virus (ADN ou ARN). Dans cette unité nous pouvons extraire l’ADN ou l’ARN, l’amplifier par PCR (ADN) ou RT-PCR (ARN), vérifier l’amplification par électrophorèse, purification des amplicons puis séquençage. De plus, nous pouvons aussi effectuer le génotypage à travers la PCR en temps réelle. Cette unité est subdivisée en salle Pré et Post PCR.
La salle Pré PCR est dédiée à l’extraction de l’ADN ou l’ARN et à la préparation des mixtes PCR. Elle
dispose les équipements suivants :

• 6 sets (P1000, P200 et P20) de micropipettes dont 2 dédiées à l’extraction de l’ADN, 2 à l’extraction de l’ARN, 2 pour la préparation des mixtes PCR ou RT-PCR,
• 4 micropipettes multicanaux (2MP200 et 2MP10)
• 2 centrifugeuses non réfrigérées (Figure 1b)
•  1 centrifugeuse réfrigérée
• 2 Minicentrifugeuses
• 2 agitateurs vortex
• 2 incubateurs Bain Marie à sec (Figure 1a) pour les tubes de 1,5 et 2 ml
• 1 Mini hotte pour préparation des Mixtes PCR
• 1 broyeur à billes
• 2 congélateurs armoires – 20°C

La salle Post PCR dédiée à l’amplification du matériel génétique et la révélation des amplicons. Elle dispose des équipements suivants :

• 1 set (P1000, P200 et P20) de micropipettes
• 1 micropipette multicanaux 8MP20
• 1 agitateur vortex
• 1 microcentrifugeuse
• 2 Thermocyclers conventionnels (Figure 2a)
• 1 PCR en temps réel (RT-PCR) (Figure 2b)- 1 réfrigérateur
• 2 systèmes d’électrophorèses RunOne complets
• 1 transluminateur associé à un système d’imagerie t muni d’un appareil photo
• 1 mini balance électronique

Cette unité est dédiée aux différentes recherches qui nécessitent les cultures cellulaires dans les conditions d’asepsie. Dans cette unité nous pouvons effectuer l’isolement et la culture bactérienne, parasitaire et fongique. Elle dispose les équipements suivants :

• 1 hotte à flux laminaire ou poste de sécurité microbiologique (Figure 3)
• 2 loupes avec caméras
• 2 microscopes avec caméras.
• 2 Etuves bactériologiques ou incubateurs
• 1 pH mètre
• 1 Centrifugeuse non réfrigérée
• 1 Etuve de séchage
• 1 agitateur vortex
• 1 agitateur magnétique
• 1 balance électronique
• 1 réfrigérateur armoire
• Etc.

Fonctionnement/Organigramme
Le laboratoire est sous l’autorité administrative du Directeur de l’IRET. Son fonctionnement au
quotidien est placé sous la responsabilité d’un chercheur désigné en interne par le Directeur de l’IRET.

Financements du laboratoire
Le laboratoire de Biologie Moleculaire et Microbiologie bénéfie des subventions de l’Etat gabonais pour la prise en charge des charges fixes (électricité, eau, nettoyage, etc.). Toutefois, pour la période allant de 2009 à 2014, il a bénéficié du financement du projet PROCOBHA. Après cette période les activités de recherche menées au laboratoire sont entièrement financées par les projets exécutés en partenariat avec des chercheurs expatriés.

Activités de recherches du laboratoire

1- Au sein de l’unité de Biologie Moléculaire

• Identification génétique des espèces (plantes, animales, plantes, bactéries, champignons, parasites et virus) au sein d’un écosystème,
• Criblage génétique des espèces virales, bactériennes et parasitaires dans un liquide physiologique ou un organe,
• Etude de la diversité génétique des populations et les facteurs environnementaux affectant cette diversité,
• Etude de la dispersion des gènes au sein d’une population et les facteurs environnementaux influençant cette dispersion,
• Traçabilité génétique pour la lutte contre le trafic illégal des ivoires et des essences forestières les plus exploitées au Gabon

2- A sein de l’unité de Microbiologie

• Caractérisation des zoonoses dues aux pathogènes bactériens, fongiques et parasitaires,
• Isolement et caractérisation biochimique des champignons ayant un grand intérêt dans les écosystèmes,
• Criblage in vitro des activités antibactériennes, antiparasitaires et antifongiques des plantes médicinales (en collaboration avec l’IPHAMETRA).